La plus grande des îles de l'archipel d'Amakusa, qui s'étend au sud-ouest de Kumamoto en mer de Chine orientale, est Shimo-jima. Là, quelques villages de pêcheurs abritent, aussi bizarre que cela puisse paraître, une église, témoignant ainsi de l'histoire religieuse de l'archipel. Il accueillit en effet les premiers missionnaires, portugais, qui convertirent les Japonais au christianisme. On sait le destin de répression que ces derniers subirent avant de pouvoir à nouveau exercer leur foi en toute liberté et reconstruire leurs lieux de culte.