De la cour intérieure bordée d'arcades, empruntez le grand escalier jusqu'à l'étage où se trouvait l'hôpital proprement dit. La grande salle des Malades, divisée en deux nefs, abritait une centaine de lits. L'Aphrodite de Rhodes, du Ier s. av. J.-C., est une des merveilles du Musée archéologique qui réunit des objets issus des fouilles effectuées sur l'île pendant la période italienne, des stèles et des statues d'époque hellénistique de l'école rhodienne et des mosaïques romaines.