Au sud du Prado, le long du paseo, le jardin botanique de Madrid fut réalisé par Juan de Villanueva à la demande du roi Charles III. Inauguré en 1781, il visait à faire connaître les variétés de plantes venues de toutes les possessions espagnoles. Ses arbres très variés offrent une fraîcheur bienvenue. Les serres présentent une intéressante sélection de plantes du désert et des forêts équatoriales.